Muy antiguo linaje, originario de Navarra. Desde tiempo inmemorial hubo un solar de este apellido en el lugar de Góngora, del Ayuntamiento de Aranguren y partido judicial de Aoiz. Si los caballeros del linaje dieron nombre al citado lugar, o si, por el contrario, tomaron de él su apellido Góngora, es cosa que no está esclarecida. Sólo se sabe que uno de los más antiguos varones de la familia Góngora fue Ximeno de Góngora, de quien dice Argote de Molina que se halló en la batalla de las Navas de Tolosa. Otro, que se llamó Machín de Góngora, fue Señor de Ciordia, villa del partido judicial de Pamplona, perteneció al bando Agramontés, y murió en lucha con el bando contrario de los Beamontés. Posteriormente la rama principal de ese solar navarro, o sea la de los Señores de Góngora, ostentó el título de Marqués de Góngora. También fueron los caballeros de esta rama Señores de Ciordia, San Adrián y Olazagutia. Su genealogía puede verse en nuestra "Enciclopedia Heráldica y Genealógica", información del apellido Góngora, página 20 del tomo XL. Del solar del lugar de Góngora procedió Pedro Jiménez Bandomes de Góngora, que acompañó al Rey de Castilla don Fernando III en la conquista de Córdoba, como General de la Caballería de Navarra, y quedó heredado en dicha ciudad, concediéndosele una capilla en la antigua mezquita, al ser consagrada al culto católico. También acompañó al Rey don Fernando en la citada conquista otro caballero del mismo linaje llamado Alfón López de Góngora. Dichos conquistadores fundaron las ilustres casas del linaje Góngora, en Córdoba, que entroncaron con nobles familias andaluzas. Los Góngora cordobeses se extendieron después por las provincias de Jaén, Murcia y Almería.

Escudos de Armas del apellido:
El Doctor Labayru y otros autores dicen que las primitivas armas del linaje fueron: En campo de gules, cinco lobos pasantes de oro, puestos en sotuer. Salazar equivoca los esmaltes al decir que el campo de este escudo es de plata y los lobos de sable. Luego fueron modificadas esas armas, y los Góngoras, Señores de la villa de Ciordia y del lugar de Góngora, en Navarra, las usaron así: De azur, tres bandas de oro, cargada cada una de tres lobos de sable, andantes. El Nobiliario Vascangado, manuscrito y anónimo, dice que las bandas de ese escudo eran de plata. Hita, en el tomo II, folio 399, de sus "Blasones", equivoca la composición de dichas armas, pues afirma que su campo es de sinople y llama fajas a las bandas. También usaron, en Navarra, algunos Góngora, este escudo: Contrafajado de plata y azur de catorce piezas, las de metal cargadas de tres lobos pasantes de sable. Argote de Molina difiere de Labayru y de otros tratadistas al describir las armas primitivas de los Góngora, pues escribe que éstas eran de gules con cinco leones de oro, antes de que don Ximeno de Góngora se hallase en la batalla de las Navas de Tolosa, y que después en memoria de ella, las modificó el citado caballero organizándolas de este modo: En campo de plata una cruz llana de gules que llena consta claramente en el expediente de pruebas del Caballero de Alcántara, Juan Jiménez de Góngora y Castillejo, natural de Córdoba y primer Marqués de Almodóvar de Trasierra.

Simbología de los escudos de Armas:
Teniendo en cuenta la indumentaria que en la Edad Media vestían los caballeros en la batalla (armadura, celada, etc.), y que los hacía irreconocibles, resultaba necesario buscar un método de identificación y distinción entre los contendientes, que fuera revelador, preciso y rápido a una cierta distancia. De ahí surge la fórmula de exhibir en sus escudos tinturas, emblemas, etc., que los diferenciase de forma inequívoca y singular en el campo de batalla. Por eso la simbología heráldica, en su origen, buscaba formas y colores que fuesen notorios y permitiesen distinguir a sus portadores de un golpe de vista. Tal vez es exagerada la tendencia de algunos autores de dar significado o contenido a todos los emblemas (piezas, muebles, etc.) y esmaltes heráldicos, aun así hay varios tratados que estudian la simbología de los blasones de forma muy exhaustiva, entre ellos: "Ciencia Heroyca", de Don José de Avilés. Año 1725; y "Adarga Catalana", de Don Francisco Xavier de Garma y Duràn. Año 1753 Por las Leyes de la Heráldica, cuantos lleven el oro en sus escudos están obligados a hacer el bien a los pobres y a defender a sus príncipes, peleando por ellos hasta su última gota de sangre. El oro simboliza el topacio. En las armerías de los reyes se le llama "sol", en las de los nobles con título de Duque, Marqués, Conde, etc, "topacio" y en el de la nobleza en general "oro". En su relación con los astros el oro es el Sol; de los doce signos del Zodiaco, Leo; de los elementos, el fuego; de los días de la semana, el domingo; de los meses del año, julio; de los árboles, el ciprés y de las flores, el girasol; de las aves, el gallo; de los cuadrúpedos, el león y de los peces, el delfín. La plata en las armerías recibe el nombre de Luna, en lo que se refiere a las de los soberanos; en las de los títulos, perla, y en las de los restantes nobles, plata; significa blancura, pureza, y los que la llevan en sus armas están obligados a defender a las doncellas y amparar a los huérfanos. La plata significa en su correspondencia con las piedras preciosas la perla. De los astros, la Luna; de los signos del Zodiaco, Cáncer, y de los elementos, el agua; de los días de la semana, el lunes; de los meses del año, los de enero y febrero; de los árboles, la palmera; de las flores, la azucena; de las aves, la paloma; y de los animales, el armiño. El color rojo, denominado en Heráldica, gules, simboliza el valor, la intrepidez y la valentía. Aquellos que llevan este color en sus blasones tienen la obligación de socorrer, amparar y defender, a los injustamente oprimidos. Representa al rubí, y en lo que se refiere a los signos del Zodiaco corresponde a Marte, Aries y Escorpio; como elemento, el fuego; el día, el martes y el mes, el de octubre; el metal, el cobre; árbol, el cedro y la flor, el clavel; de las aves, corresponde al pelícano. El gules en las armerías de los reyes y príncipes se llama Marte; en las de los títulos, rubí, y gules en la generalidad de la nobleza. El esmalte azul (azur) simboliza la realeza, la serenidad y la hermosura. Los que los lleven en sus armas, están obligados a socorrer a los fieles servidores de sus príncipes que "se hallan sin remuneración por sus servicios". En las piedras preciosas representa al zafiro y en los signos del Zodiaco a que se encuentra sujeto son Tauro y Libra. Su elemento es el aire; su metal, el acero; el día de la semana, el viernes; los meses, abril y septiembre; su árbol, el álamo; la flor, la violeta; su animal, el camaleón y su ave, el pavo real. El azur se llama Júpiter en las armerías reales, zafiro en las de los títulos y azur en la nobleza. El esmalte sinople es el verde. Su significado es la esperanza, la abundancia y la libertad; cuantos llevan este esmalte en su escudo quedan obligados a socorrer a los labradores en general y a los huérfanos y pobres que se encuentren oprimidos. Su signo zodiacal corresponde a Mercurio; su elemento es la tierra; el día de la semana, el miércoles; su mes, mayo; su metal, el azogue; como planta, el laurel; la flor, la siempreviva y como ave, el papagayo. En los blasones de los príncipes recibe el nombre de Venus; esmeralda, en el de los títulos y sinople en los de la nobleza en general. El sotuer o aspa se trae a las armerías españolas por la batalla de Baeza, ganada contra los moros el día de San Andrés del Año de 1227, que es la forma de la Cruz en que estuvo este Santo Apostol en su martirio. La banda significa el tahalí del caballero, y la banda que traían atravesada del hombro diestro al flanco siniestro, y por eso se expresa en esta situación en el escudo, habiéndola puesto por armas muchos de los que fueron a las cruzadas, según el color con que se distinguían las naciones. El caballero simboliza la nobleza. En los comienzos de la Edad Moderna, era "soldado de caballería, que servia a su costa con armas y caballo". Desde el reinado de Felipe III, Caballero es el "Hidalgo de Nobleza reconocida". La cruz es una pieza honorable, que representa la espada del caballero, dándose en Armería al combatiente que sacaba la espada teñida de sangre de sus enemigos. Del tiempo de las cruzadas quedaron algunas familias con la cruz por armas, para denotar que habían estado en ellas.